Телефон: +7 495 968 30 44

Основные биоматериалы для геномной регистрации

1. Буккальный эпителий (мазок из полости рта) — самый распространённый

Используется чаще всего, так как:

  • Сбор неинвазивный, безболезненный.
  • ДНК стабильна и легко выделяется.
  • Подходит для всех лабораторий, выполняющих генетические тесты.

Алгоритм взятия: стерильной щёточкой/тампоном проводят по внутренней стороне щеки 20–30 раз.

2. Венозная кровь (в пробирку с ЭДТА)

Используется, когда требуется:

  • наилучшее качество ДНК;
  • длительное хранение биобанком;
  • проведение целого спектра генетических исследований (WGS, WES, SNP-профили).

Почему ЭДТА: стабилизирует лейкоциты и предотвращает деградацию ДНК.

3. Сухие пятна крови (DBS)

Капли крови наносят на специальную карточку.

  • Удобно для транспортировки.
  • Хорошая стабильность ДНК при комнатной температуре.

Используется в популяционных и массовых генетических программах.

Дополнительные, но возможные варианты биоматериала

4. Волосы с луковицей (фолликулом)

Пригодны, но менее стандартны из-за риска получения малого количества ДНК.

5. Слюна

Собирается в специальные пробирки со стабилизатором.

  • Хороший вариант при невозможности взятия крови.
  • ДНК в слюне стабильна долгие сроки.

6. Ткани, ногти, костный материал

Используются только в особых ситуациях (судебная экспертиза, архивные образцы), т.к. выделение ДНК более трудоёмкое.

1. ПРОТОКОЛ ЗАБОРА БУККАЛЬНОГО ЭПИТЕЛИЯ (мазок из щеки)

1.1. Цель

Получение достаточного количества эпителиальных клеток для выделения высококачественной ДНК, применяемой для геномной регистрации.

1.2. Необходимое оснащение

  • стерильный одноразовый буккальный тампон/щёточка (Dacron, Nylon flocked);
  • пробирка/контейнер с крышкой (со стабилизатором или сухая);
  • штрих-код/этикетка для маркировки;
  • перчатки одноразовые;
  • маска (по необходимости);
  • антисептик для рук.

1.3. Подготовка человека

  1. Не есть и не пить 30 минут до забора (особенно избегать жирной пищи).
  2. Не жевать жвачку, не курить, не пользоваться ополаскивателем.
  3. При наличии остатков пищи — прополоскать рот чистой водой.

1.4. Подготовка персонала

  1. Обработать руки антисептиком.
  2. Надеть перчатки.
  3. Подготовить подписанные пробирки.

1.5. Алгоритм забора

  1. Попросить человека слегка приоткрыть рот.
  2. Ввести стерильную щёточку на внутреннюю поверхность щеки.
  3. Плотно прижать щёточку к слизистой.
  4. Выполнить энергичные вращательные движения по внутренней стороне щеки 20–30 раз, перемещая тампон вдоль поверхности.
  5. Повторить процедуру со второй стороны .
  6. Извлечь щёточку, избегая касания зубов и губ.
  7. Поместить тампон в пробирку:
    • если предусмотрено — отломить ручку по пунктирной линии,
    • плотно закрыть крышку.
  8. Обязательно проверить наличие маркировки:
    • ФИО лица,
    • дата и время забора,
    • инициалы выполняющего специалиста.

1.6. Условия хранения и транспортировки

  • при комнатной температуре: 24–72 часа (зависит от системы);
  • для пробирок со стабилизатором допускается хранение до нескольких недель–месяцев;
  • избегать перегрева и прямого солнечного света.

1.7. Особые указания

  • мазок нельзя брать при наличии крови в полости рта;
  • нельзя касаться рабочей поверхностью тампона посторонних объектов;
  • если слизистая сухая — можно попросить пациента подвигать щекой.

2. ПРОТОКОЛ ЗАБОРА ВЕНОЗНОЙ КРОВИ ДЛЯ ГЕНОМНОЙ РЕГИСТРАЦИИ (в пробирку с ЭДТА)

2.1. Цель

Получение крови, содержащей лейкоциты с высокоинтактной ДНК, применяемой для генотипирования, секвенирования (WES, WGS) и других геномных исследований.

2.2. Оснащение

  • вакуумная система (держатель + игла) или шприц + игла = предпочтительно вакуум;
  • пробирка с ЭДТА (фиолетовая крышка);
  • спиртовые салфетки/антисептик;
  • жгут;
  • ватные или марлевые салфетки;
  • контейнер для утилизации игл;
  • перчатки.

2.3. Подготовка персонала

  1. Вымыть руки/обработать антисептиком.
  2. Подготовить пробирку (не вскрывая).
  3. Надеть перчатки.

2.4. Идентификация лица

Перед процедурой назвать:

  • ФИО, дату рождения;
  • сверить данные с направлением;
  • уточнить аллергии (на латекс, антисептики).

2.5. Пошаговый алгоритм забора

Шаг 1. Подготовка

  1. Усадить или уложить человека удобно.
  2. Наложить жгут на 7–10 см выше места венепункции.
  3. Осмотреть вену, выбрать оптимальную (обычно v. mediana cubiti).
  4. Обработать кожу спиртовой салфеткой и дождаться высыхания.

Шаг 2. Венепункция

  1. Вставить иглу в держатель.
  2. Зафиксировать кожу натяжением.
  3. Выполнить венепункцию под углом ~30°.
  4. Вставить пробирку с ЭДТА в держатель, обеспечив автоматический набор крови.

Шаг 3. Наполнение пробирки

  1. Дождаться заполнения пробирки до номинального уровня (важно для правильного соотношения крови и антикоагулянта).
  2. Извлечь пробирку из держателя.
  3. Ослабить и снять жгут.
  4. Извлечь иглу и сразу прижать место пункции стерильной салфеткой.

Шаг 4. После взятия крови

  1. Попросить человека удерживать салфетку 5–7 минут.
  2. Пробирку перевернуть 8–10 раз (не встряхивать!) для равномерного смешивания крови с ЭДТА.
  3. Проверить маркировку:
    • ФИО / личный номер В/С;
    • дата и время забора;
    • тип антикоагулянта.

2.6. Минимальный необходимый объём

  • стандарт: 4–6 мл крови в пробирку 5–6 мл;
  • при высокоточном секвенировании — по требованию.

2.7. Условия хранения и транспортировки

  • +2…+8 °C — допустимо хранение до 48–72 ч;
  • при комнатной температуре — не более 24 ч;
  • НЕ замораживать цельную кровь в ЭДТА;
  • доставлять в вертикальном положении.

2.8. Недопустимые ситуации

  • недолив пробирки (неправильное соотношение кровь/антикоагулянт);
  • гемолиз (розовая/красная плазма);
  • сгустки (несвоевременное перемешивание);
  • кровь после длительного жгута (>1 мин);
  • пациент согнул руку в локте — риск гематомы и гемолиза.